Polyarthrite rhumatoïde	CD8 d ou n ; NKd ou n ; TS d ou n ; Tis d;IL2 d ou n;CMA d ou n;Ac de faible avidité
Polyarthrite juvénile	CD8 d ou n ; NK d ; TS d ou n ; TiS d
Syndrome de Gougerot-Sjögren	TS d ou n ; CMA d
Sclérodermie systémique	T activé n ; T d ; CD8 d ; NK et NKT d ; T coopérants a ; TS n ; PGE a ; IL1 d ; CMA d ou n
Maladie de Basedow	T d ou n ; TS d ; CMA d
Thyroïdite d'Hashimoto	T d ou n ; NK d ; CMA n
Diabète insulino-dépendant*	T activé ; T et sous-population variable, NK d TS d ou n ; TS spec. d ; IL2 d
Cirrhose biliaire primitive	TS d ; CMA d ; PGE a
Hépatite chronique autoimmune	TS d ; PGE a
Sclérose en plaque	T activé ; CD8 d ou n ; NK et NKT d ; CMA d
Maladie coeliaque	T activé ; NK d ; TS d ou n ; PGE a
Maladie de Crohn	T activé ; TS d ou n
Myasthénie	CD8 d ou n ; TS d ou n

d = diminué
a = augmenté
n = normal
TS = T suppresseurs
Tis = T inducteurs de suppression
CMA = culture mixte autologue
* dans le modèle des NOD, IL4 d (l'injection d'IL4 prévient le diabète).